Старший биоинформатик (анализ данных длинноридового секвенирования)

Описание

Отдел системной биологии и биоинформатики ищет опытных биоинформатиков для работы с данными длинноридового секвенирования человека. Мы занимаемся формированием внутренних стандартов и best practices биоинформатической обработки данных, а также сопровождением биомедицинских исследований.

Стек технологий:

• Язык разработки: Python, bash
• Работа с пайплайнами: Docker, CWL
• Совместная работа над кодом: GitLab

Обязанности:

• Разработка пайплайна для биоинформатической обработки и контроля качества данных длинноридового секвенирования.
• Разработка пайплайнов для de novo сборки и коллинга структурных вариантов по данным длинноридового секвенирования.
• Планирование и контроль проведения экспериментов в лаборатории для подтверждения найденных структурных вариантов.
• Участие в создании и поддержке внутренних баз данных.
• Разработка и ведение технической документации, методических документов.
• Написание научных публикаций, представление на конференциях результатов исследований.

Требования:

• Опыт работы с данными длинноридового секвенирования (Nanopore, Pacbio).
• Навыки самостоятельной работы; готовность брать на себя ответственность за результат.
• Готовность заниматься методической работой, написанием технической документации.
• Внимательность, аккуратность.
• Наличие опыта работы в лаборатории (выделение ДНК/РНК, подготовка библиотек для секвенирования, валидация результатов биоинформатического анализа молекулярными методами) будет плюсом.

Организационные требования:

• Наличие диплома о высшем образовании. В приоритете техническое, математическое, биоинформатическое, медико-биологическое образование.
• Минимум 7 лет стажа работы по специальности или наличие кандидатской степени.
• Очное присутствие в офисе в Москве обязательно.

Будет плюсом:

• Понимание принципов работы технологий высокопроизводительного секвенирования.
• Наличие открытых репозиториев на Github.
• Умение работать с вычислительными кластерами.
• Инициативность.

Условия:

• Конкурентная заработная плата, обсуждается индивидуально в зависимости от опыта работы.

• Офисный формат работы, полная занятость, пятидневный график работы с гибким началом дня.

• Стабильная организация, которой не страшен кризис.
• Прикрепление к ведомственной поликлинике ФМБА.
• Выход на работу не ранее первого квартала 2026 года.